| Campeón: Sevilla CF Promoción de descenso a Segunda: RCD Español Descenso a Segunda: CD Alcoyano y Hércules CF Promoción de ascenso a Primera - Jugado en Madrid. 19-05-1946 RCD Español 0 - 0 Gimnástico de Tarragona Desempate - Jugado en Barcelona. 26-05-1946 RCD Español 3 - 0 Gimnástico de Tarragona Permanece en Primera: RCD Español |
| Campeón: CD Sabadell CF Ascenso a Primera: CD Sabadell CF y RC Deportivo Promoción de ascenso a Primera: Gimnástico de Tarragona Promoción de descenso a Tercera: Jerez Descenso a Tercera: UD Salamanca y SD Ceuta Promoción de ascenso a Primera - Jugado en Madrid. 19-05-1946 RCD Español 0 - 0 Gimnástico de Tarragona Desempate - Jugado en Barcelona. 26-05-1946 RCD Español 3 - 0 Gimnástico de Tarragona Permanece en Primera: RCD Español Promoción de ascenso a Segunda - Jugado en Madrid. 29-06-1946 Xerez 0 - 2 CD Baracaldo (prórroga) Ascenso a Segunda: CD Baracaldo Descenso a Tercera: Xerez |
| Campeón: UD Orensana Fase Intermedia: UD Orensana, SD Ponferradina y Pontevedra CF Promoción descenso a Regional: Club Galicia |
| Campeón: Círculo Popular Fase Intermedia: Círculo Popular, RSG Torrelavega y CD Tánagra Promoción descenso a Regional: Real Juvencia |
| Campeón: Arenas de Guecho Fase Intermedia: Arenas de Guecho, Club Sestao y CD Baracaldo Promoción descenso a Regional: Unión Club |
| Campeón: Arenas SD Fase Intermedia: Arenas SD, CD Logroñés y Maestranza Aérea Promoción descenso a Regional: CD Borja |
| Campeón: CF Badalona Fase Intermedia: CF Badalona, CD Jupiter y Reus Deportivo Promoción descenso a Regional: UD Lérida |
| Campeón: Levante UD Fase Intermedia: Levante UD, CD Constancia y Atlético Baleares Promoción descenso a Regional: UD Teruel |
| Campeón: Albacete Balompié Fase Intermedia: Albacete Balompié, Elche CF y CD Almansa Promoción descenso a Regional: Crevillente CF |
| Campeón: Real Valladolid Fase Intermedia: Real Valladolid, Imperio CF y Cultural Leonesa Promoción descenso a Regional: Gimnástica Segoviana |
| Campeón: CD Badajoz Fase Intermedia: CD Badajoz, CP Cacereño y CD Toledo Promoción descenso a Regional: SD Emeritense |
| Campeón: CD Málaga Fase Intermedia: CD Málaga, Olímpica Jiennense y CDR Melilla Promoción descenso a Regional: Algeciras CF |
| Permanencia en Tercera: Gimnástica Segoviana Ascenso a Tercera: Juvenil Coruña, Caudal Deportivo, Cultural Durango, Belchite CF, Igualada CF, Segarra, Orihuela Deportiva, Electromecánicas y Atlético Tetuán Descenso a Regional: Club Galicia, Real Juvencia, Real Unión, CD Borja, UD Lérida, UD Teruel, Crevillente CF, SD Emeritense y Algeciras |
| Fase Final: Real Valladolid |
| Fase Final: CD Baracaldo |
| Fase Final: Arenas SD |
| Fase Final: Levante UD |
| Fase Final: CD Málaga |
| Ascenso a Segunda: CD Málaga y Levante UD Promoción de ascenso a Segunda: CD Baracaldo Promoción de ascenso a Segunda - Jugado en Madrid. 29-06-1946 Xerez 0 - 2 CD Baracaldo (prórroga) Ascenso a Segunda: CD Baracaldo Descenso a Tercera: Xerez |